看了MiSeq臺式DNA測序儀的用戶又看了
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*短的時間內(nèi)獲得答案,智能化的工作流程,廣泛的測序應(yīng)用范圍
Illumina公司推出的MiSeq是目前**一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀,每次運行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù),且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和無可比擬的準確性,這讓它成為快速且經(jīng)濟高效的遺傳分析的理想平臺,適合廣泛的應(yīng)用。同時根據(jù)Illumina的**消息,今年9月份左右,MiSeq系統(tǒng)的測序通量將會升級至7G左右。升級將通過兩個方面完成,一個是cluster密度的增大,升級后cluster密度將會增加至12-15million,而pair-end讀取的reads數(shù)目將會增加至24-30million;另一方面是通過測序讀長而提升通量,屆時測序讀長會達到2*250bp,同時測序速度也會有所提升。目前,Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實現(xiàn)了單端測序300bp讀長,Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。
MiSeq性能參數(shù)
工作流程
4大特性
1、*短的實驗周期:從樣品制備開始只需要8小時即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。
2、*便捷的樣品制備流程:只需50ngDNA模板,2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、*精確的測序原理:MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理,數(shù)千篇高質(zhì)量的國際期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結(jié)果可信度*有力的證明。
4、*完整的整合功能:MiSeq可以獨立完成簇生成,雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作,讓經(jīng)費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。
應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析**平臺。公司技術(shù)團隊目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序
對16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進行高通量測序,鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細菌進行了鑒定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長**地配合了小RNA的測序長度,速度快,靈敏度高。派森諾的技術(shù)團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。
4、重測序:
包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序,每次運行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日,派森諾的技術(shù)團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌
(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍,比對至參考序列,基因組覆蓋率為100%,同時檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異,包括插入、缺失和SNP位點,并且檢測到了全部質(zhì)粒。
暫無數(shù)據(jù)!