北京格瑞德曼儀器設(shè)備有限公司
已認(rèn)證
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一、實(shí)驗(yàn)試劑:
1.CTAB抽提液:
2%(w/v)CTAB
100 mmol/L Tris-HCl(pH8.0)
20 mmol/L EDTA(pH8.0)
1.4 mol/L NaCl
抽提含多酚較多的植物材料時(shí)(比如木本植物),上述抽提液中可另加入2%的PVP(聚乙烯吡咯烷酮)。
抽提液于室溫保存,可在幾年內(nèi)保持穩(wěn)定。臨用之前向裝有上述抽提液的試管中加入約2%-3%(v/v)的β-巰基乙醇。
2、醋酸鈉:
3 mol/L NaAc
用冰乙酸調(diào)pH值至4.8-5.2。
3、TE溶液:
4、其它:
無水乙醇,異丙醇,75%乙醇,酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),氯仿:異戊醇(24:1),β-巰基乙醇,重蒸水。
二、實(shí)驗(yàn)步驟
1. 樣品研磨
1) 取1g的樣品放入2ml ep管中
2) 加入1-2粒5mm研磨珠
3) 加入1ml的CTAB 抽提液
4) 將加有樣品的ep管放入高通量組織研磨儀的適配器中,蓋好
5) 將研磨轉(zhuǎn)速調(diào)到1800,設(shè)定研磨時(shí)間為90秒(可根椐樣品的研磨的難易程度來調(diào)節(jié),此數(shù)據(jù)是以銀杏落葉為樣本得出)
6) 啟動(dòng)研磨儀對樣品進(jìn)行研磨(根據(jù)不同的樣品,本身性質(zhì)不同,需要對研磨頻率和研磨時(shí)間進(jìn)行適當(dāng)?shù)恼{(diào)整)
2. DNA的粗提
1) 將研磨好的樣品取出于65℃水浴45min,中途間隔(輕柔)振蕩三次混勻
2) 冷卻后加入等體積氯仿:異戊醇(24:1),輕柔顛倒混勻使乳化10min
3) 7000g-8000g離心10min(18-20℃)
4) 吸取上清于另一干凈的離心管中
5) (根據(jù)需要可用氯仿:異戊醇如上法重復(fù)抽提一次,吸取上清)
6) 加入與上清液等體積(且已于-20℃預(yù)冷的異丙醇,顛倒混勻,約1至2分鐘后應(yīng)有白色絮狀沉淀出現(xiàn)(若沒有,則加入上清液1/5至1/10體積的pH4.8-5.2的3M NaAc,混勻,于-20℃冰箱中沉淀30min)
7) 離心法沉淀DNA
8) 在75%乙醇中漂洗DNA數(shù)分鐘以上,用Tip頭吸干乙醇
9) 用1ml 75%乙醇再漂洗一次
10) 沉淀于室溫或64℃以下的恒溫箱中干燥片刻至剛出現(xiàn)半透明,不要過度干燥
11) 用50μlTE溶解沉淀,可用65℃水浴助溶,DNA粗提物可用于粗略PCR等。
3. DNA的純化
1) 向TE溶解的DNA粗提物中入4-10μl RNaseA(約40-100μg)
2) 于37℃酶解RNA 1hr或65℃酶解RNA 30min以上
3) 加入50μl酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),輕輕顛倒混勻10min
4) 10000g以上常溫離心10min,吸取上清
5) 加入50μl仿氯:異戊醇(24:1)輕輕顛倒10min
6) 10000g以上常溫離心10min,吸取上清 (根據(jù)需要可重復(fù)用氯仿:異戊醇如上法再抽提1-2次,以充分去除蛋白和酚)
7) 向上清中加入1/5-1/10體積的pH4.8-5.2的3M NaAc,并加入2.5倍體積無水乙醇,于-20℃沉淀30min以上
8) 12000g、4℃低溫離心10min,吸干液體
9) 沉淀用75%乙醇漂洗二次
10) 沉淀于室溫或64℃以下恒溫箱中干燥片刻至剛開始出現(xiàn)半透明狀,勿過度干燥加入50μl重蒸水溶解DNA,可于65℃水浴助溶
11) 取5μl DNA電泳檢查DNA的質(zhì)量
12) 100-500倍稀釋后于分光光度計(jì)上測定OD260及OD280,分析DNA的濃度和質(zhì)量
13) 保存DNA于-20℃
補(bǔ)充:如果需要提取的樣品比較多(比如1g),研磨好的樣品在后續(xù)的提取中,需要轉(zhuǎn)移到大的epp管中,研磨時(shí)可以加入較少的抽提液,研磨完畢按照1g樣品10ml提取液補(bǔ)充抽提液,進(jìn)行后續(xù)的操作。
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