編號(hào)：NMJS03238
篇名：平行板納米通道中生物分子遷移的分子模擬
作者：劉坤； 張曉玲； 肖松文； 巴德純；
關(guān)鍵詞：分子模擬； 納流控； 蛋白質(zhì)分子； 離子； 遷移特性；
機(jī)構(gòu)： 東北大學(xué)機(jī)械工程與自動(dòng)化學(xué)院； 首都航天機(jī)械公司；
摘要： 基于GROMACS程序包,建立了蛋白質(zhì)分子和離子在平板型納米通道內(nèi)的流動(dòng)模型,對(duì)3.1 nm高的平行板納米通道內(nèi)的遷移過(guò)程進(jìn)行了分子模擬,并對(duì)均方根偏差分布、水分子密度分布、離子濃度分布等模擬結(jié)果進(jìn)行了討論.結(jié)果表明:水分子在壁面附近出現(xiàn)分層現(xiàn)象,并且形成致密層,密度達(dá)到2 500 kg/m3,在中間區(qū)域分布平穩(wěn);蛋白質(zhì)分子在離子和電場(chǎng)作用下做翻轉(zhuǎn)和平移運(yùn)動(dòng),沿著電場(chǎng)方向通過(guò)管道;通過(guò)比較通道表面帶電和不帶電兩種情況下的粒子分布,得出通道壁面對(duì)溶液中離子的靜電作用是出現(xiàn)"電荷倒置"現(xiàn)象的原因.
