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便攜式植物表型平臺KeyBox
便攜式植物表型平臺KeyBox

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荷蘭

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上海澤泉科技股份有限公司

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歐盟**的農(nóng)業(yè)生物科技公司——荷蘭KeyGene公司,是一家專注于提供基因型-表型分析和性狀及關(guān)聯(lián)基因挖掘服務(wù)的公司。自從2011年由KeyGene公司和德國LemnaTec共同建立的歐洲植物表型平臺PhenoFab投入運轉(zhuǎn)后,迅速積累了大量的基因型-表型測量和分析經(jīng)驗,并取得了異常出色的結(jié)果,從而導致PhenoFab一直處于滿負荷運轉(zhuǎn)狀態(tài)。

基于大量的PhenoFab使用經(jīng)驗和數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ),KeyGene研發(fā)出了一款國際上*小的便攜式植物表型平臺KeyBox。

考慮到KeyBox可能需要經(jīng)常帶到溫室、野外或其它地方進行測量,因此它被設(shè)計成可快速拆卸、打包的樣式。將KeyBox打包后,就成為一個拉桿箱,方便運輸和攜帶。

折疊前 折疊后

技術(shù)路線

操作軟件

KeyBox的工作軟件Pheno-suiteKeyGene公司強大的生物信息學和軟件團隊開發(fā),充分考慮在實際應(yīng)用的需求,操作簡單,功能強大。

Pheno-suite的工作模塊包括:

l 基礎(chǔ)整合模塊。內(nèi)置在軟件中,是軟件的基本組成部分。

l 選配模塊。功能強大,針對應(yīng)用的每個算法是一個模塊,客戶可以根據(jù)需求選配。

基礎(chǔ)整合模塊

功能強大的選配模塊

l 顏色校準 Color correction

l 標簽識別 Label recognition

l 灰度圖轉(zhuǎn)換 Gray scale conversion

l 生物量測量 Biomass detection

l 形態(tài)大小測量 Tomato size

l 種子萌發(fā)測量 Seed germination in tray

l 葉片大小測量 Leaf size detection

KeyGene在不斷的研究新算法,新模塊出來后可以付費升級。

應(yīng)用實例

1、下圖中,利用KeyBox測量了辣椒的像素大小和破損部位的像素大小,這樣就得出了辣椒的破損程度。

2、 下圖中,利用KeyBox測量了甜瓜的像素大小、黑點的像素大小,得出黑點的占比。還測量了甜瓜的圓度。

3、下圖中,利用KeyBox測量了一個葉片的尺寸和形態(tài)參數(shù)。

4、下圖中,利用KeyBox測量了一個104孔的芽盤中,種子的萌發(fā)情況,精確識別萌發(fā)的種子和未萌發(fā)的種子,計算出萌發(fā)率。

5、下圖中,利用KeyBox研究了擬南芥野生型和突變株對霉病的抗性,精確計算出病變部位的像素大小。

主要功能

l對植物體進行整株或器官(果實、種子、根系、葉片、幼苗等) 的表型成像

l 便攜可折疊式設(shè)計,方便帶到溫室或野外使用

l 標準光照環(huán)境,數(shù)據(jù)可重復

l 經(jīng)驗豐富的專家根據(jù)應(yīng)用經(jīng)驗設(shè)計的軟件,操作簡單,解決農(nóng)業(yè)應(yīng)用中遇到的問題

l 內(nèi)置顏色校正和讀取電子標簽的程

l 可選一系列的功能程序模塊,并不斷升級中

應(yīng)用領(lǐng)域

l 表型性狀分析/挖掘,基因型-表型關(guān)聯(lián)

l 農(nóng)業(yè)育種

l 園藝學、農(nóng)業(yè)信息學

l 果實品質(zhì)分析

l 植物病理研究

l 生物量分析

l 種子萌發(fā)研究

l 抗逆研究

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