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一鍵啟動(dòng)——數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)

一鍵啟動(dòng)——數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)
貝克曼庫爾特生命科學(xué)  2024-06-27  |  閱讀:548

數(shù)字PCR(Digital PCR,dPCR)是一種核酸分子絕對(duì)定量技術(shù),它通過直接計(jì)數(shù)DNA分子的個(gè)數(shù)來實(shí)現(xiàn)對(duì)起始樣品的絕對(duì)定量。


作為基于微流控的新一代PCR技術(shù),這三點(diǎn)優(yōu)勢(shì)讓它能在一眾PCR檢測(cè)手段中突出重圍。


絕對(duì)定量:

數(shù)字PCR能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),實(shí)現(xiàn)對(duì)起始樣品的絕對(duì)定量,避免了傳統(tǒng)定量PCR中相對(duì)定量的局限性。


高靈敏度:

數(shù)字PCR能夠檢測(cè)出低頻率的突變和表達(dá)變化,提高了檢測(cè)的靈敏度和準(zhǔn)確性。


可靠性:

數(shù)字PCR采用統(tǒng)計(jì)學(xué)原理進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,能夠降低實(shí)驗(yàn)誤差和假陽性率,提高結(jié)果的可靠性。


從實(shí)驗(yàn)流程上看,數(shù)字PCR檢測(cè)可分為以下四個(gè)步驟:


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圖一:數(shù)字PCR檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)流程展示


隨著檢測(cè)通量以及實(shí)驗(yàn)樣本處理方式的復(fù)雜度持續(xù)升級(jí),體系制備成為了讓科學(xué)家們頭疼的難題,主要體現(xiàn)在體系配置工作量大,手工重復(fù)性差,前處理耗時(shí)長等。


為幫助科學(xué)家們?cè)隗w系配置上的難題,小貝為科學(xué)家們推薦一款輔助工具——Biomek i系列自動(dòng)化移液工作站。


自動(dòng)化ddPCR(微滴式數(shù)字PCR)體系配置


高通量處理:

自動(dòng)化ddPCR系統(tǒng)能夠一次性處理大量樣本,大大提高了實(shí)驗(yàn)通量,減少了人工操作的時(shí)間和誤差。


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圖二:以多重?cái)?shù)字PCR檢測(cè)重組腺相關(guān)病毒(rAAV)病毒基因組拷貝數(shù)實(shí)驗(yàn)流程為例,1小時(shí)可完成6*96個(gè)待測(cè)樣本的體系配置。


降低人工成本:

自動(dòng)化ddPCR系統(tǒng)可以減少對(duì)專業(yè)操作人員的依賴,降低人工成本。


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圖三:自動(dòng)化軟件dPCR全流程自動(dòng)化程序展示。標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程,全自動(dòng)化完成,無需人員進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作


結(jié)果保障:

可重復(fù)性,精確度高,穩(wěn)定的結(jié)果輸出。


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圖四:圖A為自動(dòng)化標(biāo)準(zhǔn)品梯度稀釋試驗(yàn),結(jié)果表明定量限可低至 20 拷貝/反應(yīng),檢測(cè)限可至 5~10 拷貝/反應(yīng),ddPCR 方法能更好的用于標(biāo)準(zhǔn)品的定量和殘留檢測(cè)。


圖B為 AAV 基因組滴度檢測(cè)的代表性圖譜,通過對(duì) 自動(dòng)化AAV 樣品的前處理,再通過 ddPCR 系統(tǒng)進(jìn)行液滴生成并進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增后讀取液滴信號(hào),結(jié)果表明使用 ddPCR 對(duì)病毒滴度進(jìn)行檢測(cè),其結(jié)果陰陽性區(qū)分明顯,易于分析,結(jié)果準(zhǔn)確,并且相同樣品不同天檢測(cè) CV 值 ≤10%。


未來數(shù)字PCR可拓展的應(yīng)用領(lǐng)域:


精準(zhǔn)醫(yī)學(xué):

數(shù)字PCR在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用將進(jìn)一步拓展,包括基因表達(dá)差異研究、拷貝數(shù)變異(CNV)研究、腫瘤治療的伴隨診斷等。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的精確定量,為疾病的診斷和治療提供有力支持。


環(huán)境監(jiān)測(cè):

隨著全球?qū)ι锇踩铜h(huán)境保護(hù)的重視,數(shù)字PCR在環(huán)境監(jiān)測(cè)領(lǐng)域的應(yīng)用也將逐漸增多。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以檢測(cè)和監(jiān)測(cè)環(huán)境中的致病微生物和污染物,為環(huán)境保護(hù)和公共衛(wèi)生安全提供重要保障。


農(nóng)業(yè)遺傳改良:

在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,數(shù)字PCR技術(shù)可以用于農(nóng)作物基因變異的檢測(cè)和分析,為育種工作提供有力支持。通過數(shù)字PCR技術(shù),可以更加精確地檢測(cè)和分析農(nóng)作物中的基因變異,為培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病的農(nóng)作物品種提供技術(shù)支持。


貝克曼庫爾特生命科學(xué)提供專業(yè)的軟件硬件支持,以及客戶應(yīng)用開發(fā)來滿足大家對(duì)于生命科學(xué)自動(dòng)化的需求。


關(guān)于貝克曼自動(dòng)化整合部門介紹:

1 貝克曼庫爾特生命科學(xué)自動(dòng)化整合部門位于美國Indianapolis,該部門位于Beckman質(zhì)量管理系統(tǒng)下,并經(jīng)過ISO9001認(rèn)證,部門配備整合實(shí)驗(yàn)室,完成整合設(shè)備的研發(fā)。


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2 整合部門人員包含機(jī)械、電子、軟件、系統(tǒng)工程師,和工程師支持、項(xiàng)目管理人員。人員配備齊全,售前售后響應(yīng)快速。


3 如有特殊功能開發(fā),Beckman團(tuán)隊(duì)可協(xié)助客戶在國內(nèi)進(jìn)行軟硬件開發(fā)和測(cè)試。

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